转录因子是一类参与基因转录调控的重要调节因子。不同转录因子的DNA 结合结构域识别不同基因启动子区特定的碱基序列,行使抑制或激活该基因转录的功能。将目的基因启动子区域(通常取转录起始位点TSS 上游-2000bp)、或针对结合位点进行突变、或分段截断序列,构建到报告基因载体luciferase 的上游,共转染转录因子过表达质粒,通过荧光素酶活反映转录因子对启动子活性的调控作用。
图1.转录因子与启动子调控示意图
常用载体:pGL3-Basic 、pGL3-Promoter
图2 .载体信息
翌圣双荧光素酶报告基因检测服务流程
客户提供 |
翌圣服务 |
客户所得 |
1、待研究启动子基因详细信息 2、转录因子详细信息 |
1、转录因子和启动子结合位点预测 2、方案设计、引物设计与合成 3、序列合成、质粒构建及细胞转染 4、荧光素酶活性检测 |
1、项目所得质粒及菌液 2、中间样品 3、完整项目报告 |
实验步骤
01
目的细胞质粒瞬转预实验
当选择在目的细胞(而非293 工具细胞)中进行验证实验时,首先要确认目的细胞的质粒瞬转效率,以及摸索合适的瞬转体系,质粒瞬转效率>40%以上时表明预实验通过。
02
目的细胞质粒瞬转预实验
a. 将状态良好,处于对数生长期的空白细胞用0.25%胰酶消化,用完全培养基悬浮成
单细胞悬液,细胞计数后,接种于24 孔培养板中;
b. 培养过夜,观察细胞生长状态。在细胞覆盖率70%左右时,进行转染实验;
c. 转染2 h 前换液为新鲜的培养基;
d. 转染取无菌的1.5 mL EP 管,按照转染试剂使用说明进行转染复合物配置
e. 转染48 h 后收集细胞样品。
03 报告基因检测
§
细胞样品收集
a. 转染后从培养箱中取靶细胞,轻轻吸净培养液,PBS 洗涤2 次;
b. 弃去PBS,每孔加入100μL 的1×PLB(5X Passive Lysis Buffer 用无菌水稀释而得);
c. 细胞裂解后,将样品转移入Ep 管中,-80 度冰箱保存。
§
根据报告基因检测试剂盒说明书操作进行检测
§
a. 将充分裂解后的裂解产物,10,000-15,000 rpm 离心3-5 min。离心后将上清液移入新的EP 管进行后续检测。
b. Renilla Luciferase Assay 工作液的配置:按照样品要求的量,将Renilla Luciferase Assay Reagent(100×)按照稀释比例加入Renilla Luciferase Assay buffer,混匀后室温放置。
c. 荧光素酶检测:
按照仪器说明书要求将荧光检测打开,设定参数,测定时间为10 s,测定间隔为2 s;将样品按照20 μL 的体积加入测量管中(保持每次样品的加样量一致),另外加入20 μL Firefly Luciferase Assay Reagent 混匀2-3 次(不能漩涡混匀),充分混匀后测定RLU(Relative light unit),同时设置Cell Lysis buffer 为空白对照孔;将检测后的样品,加入20 μL 配制的Renilla Luciferase Assay 工作液混匀2-3 次,充分混匀后测定RLU,同时设置Renilla Luciferase Assay 工作液为空白对照孔。
04
数据处理与分析,计算相对荧光强度
05
提供原始实验数据与完整实验报告
常规检测分组
(1)过表达对照+启动子对照+海肾内参(TK)
(2)过表达对照+启动子野生型+海肾内参(TK)
(3)过表达对照+启动子突变型+海肾内参(TK)
(4)转录因子过表达+启动子对照+海肾内参(TK)
(5)转录因子过表达+启动子野生型+海肾内参(TK)
(6)转录因子过表达+启动子突变型+海肾内参(TK)
实验预期结果
01
转录因子促进靶基因启动子区转录活性
02
转录因子抑制靶基因启动子区转录活性
翌圣可提供双荧光素酶报告基因检测服务,加快基础研究及药物筛选进度
服务类型 |
客户提供 |
服务内容 |
周期 |
双荧光素酶验证miRNA 与靶基因3’UTR 相互作用 |
1、miRNA基因及物种(具体的ID信息) 2、靶基因基因及物种 3. 结合位点信息 |
1、miRNA与3’UTR结合位点预测 2、方案设计、引物设计合成 3、miRNA mimics合成、质粒构建 4、细胞转染及报告基因检测
|
25-30个工作日 |
双荧光素酶验证lncRNA 与miRNA 相互作用 |
1、lcnRNA基因及物种 2、miRNA基因及物种(具体的ID信息) 3、结合位点信息 |
1、lncRNA 与miRNA结合位点预测 2、方案设计、引物设计合成 3、miRNA mimics合成、质粒构建 4、细胞转染及报告基因检测 |
25-30个工作日 |
双荧光素酶验证转录因子与启动子区调控作用 |
1、启动子信息(名称、物种、序列) 2、启动子基因模板(或委托我司合成/克隆) 3、 实验用细胞(若选用293T细胞无需提供) |
1、转录因子与启动子结合位点预测 2、方案设计、引物设计合成 3、序列合成、质粒构建 4、细胞转染及报告基因检测 |
30-35个工作日 |
信号通路分析 |
通路下游的响应元件序列 |
1、方案设计、引物设计合成 2、序列合成、质粒构建 |
30-35个工作日 |
SNP 活性分析 |
基因的启动子区域存在单核苷酸多态性(SNP)信息 |
1、方案设计、引物设计合成 2、序列合成、质粒构建 |
30-35个工作日 |
相关产品清单
产品类别 |
产品名称 |
产品货号 |
产品规格 |
双荧光素酶报告基因检测试剂 |
Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 双萤光素酶报告基因检测试剂盒 |
11402ES60/80 |
100T/1000T |
Dual Glo Luciferase Reporter Gene Assay Kit 辉光型双荧光素酶报告基因检测试剂盒 |
11405ES60/80 |
100T/1000T |
|
转染试剂 |
Hieff Trans® Liposomal Transfection Reagent 转染试剂 |
40802ES01/03 |
100μL/1mL |
Hieff Trans® in vitro siRNA/miRNA Transfection Reagent转染试剂 |
40806ES01/02/03 |
0.1mL/0.5mL /1mL |
|
Hieff Trans® mRNA Transfection Reagent 转染试剂 |
40809ES01/03 |
0.1mL/1mL |