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干货 | 双荧光素酶验证转录因子与启动子区调控作用

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2025-03-27T00:00 (访问量:2736)

转录因子是一类参与基因转录调控的重要调节因子。不同转录因子的DNA 结合结构域识别不同基因启动子区特定的碱基序列,行使抑制或激活该基因转录的功能。将目的基因启动子区域(通常取转录起始位点TSS 上游-2000bp)、或针对结合位点进行突变、或分段截断序列,构建到报告基因载体luciferase 的上游,共转染转录因子过表达质粒,通过荧光素酶活反映转录因子对启动子活性的调控作用。

图1.转录因子与启动子调控示意图

 

常用载体:pGL3-Basic 、pGL3-Promoter

图2 .载体信息

 

翌圣双荧光素酶报告基因检测服务流程

                                             

客户提供

翌圣服务

客户所得

1、待研究启动子基因详细信息

2、转录因子详细信息

1、转录因子和启动子结合位点预测

2、方案设计、引物设计与合成

3、序列合成、质粒构建及细胞转染

4、荧光素酶活性检测

1、项目所得质粒及菌液

2、中间样品

3、完整项目报告

 

 

实验步骤

  01

目的细胞质粒瞬转预实验

当选择在目的细胞(而非293 工具细胞)中进行验证实验时,首先要确认目的细胞的质粒瞬转效率,以及摸索合适的瞬转体系,质粒瞬转效率>40%以上时表明预实验通过。

 

02

目的细胞质粒瞬转预实验

a. 将状态良好,处于对数生长期的空白细胞用0.25%胰酶消化,用完全培养基悬浮成
单细胞悬液,细胞计数后,接种于24 孔培养板中;
b. 培养过夜,观察细胞生长状态。在细胞覆盖率70%左右时,进行转染实验;
c. 转染2 h 前换液为新鲜的培养基;
d. 转染取无菌的1.5 mL EP 管,按照转染试剂使用说明进行转染复合物配置
e. 转染48 h 后收集细胞样品。

 

03 报告基因检测

§ 

细胞样品收集

a. 转染后从培养箱中取靶细胞,轻轻吸净培养液,PBS 洗涤2 次;
b. 弃去PBS,每孔加入100μL 的1×PLB(5X Passive Lysis Buffer 用无菌水稀释而得);
c. 细胞裂解后,将样品转移入Ep 管中,-80 度冰箱保存。

 

§ 

根据报告基因检测试剂盒说明书操作进行检测

§ 

a. 将充分裂解后的裂解产物,10,000-15,000 rpm 离心3-5 min。离心后将上清液移入新的EP 管进行后续检测。

b. Renilla Luciferase Assay 工作液的配置:按照样品要求的量,将Renilla Luciferase Assay Reagent(100×)按照稀释比例加入Renilla Luciferase Assay buffer,混匀后室温放置。

c. 荧光素酶检测:

按照仪器说明书要求将荧光检测打开,设定参数,测定时间为10 s,测定间隔为2 s;将样品按照20 μL 的体积加入测量管中(保持每次样品的加样量一致),另外加入20 μL Firefly Luciferase Assay Reagent 混匀2-3 次(不能漩涡混匀),充分混匀后测定RLU(Relative light unit),同时设置Cell Lysis buffer 为空白对照孔;将检测后的样品,加入20 μL 配制的Renilla Luciferase Assay 工作液混匀2-3 次,充分混匀后测定RLU,同时设置Renilla Luciferase Assay 工作液为空白对照孔。

 

04

数据处理与分析,计算相对荧光强度

05

提供原始实验数据与完整实验报告

 

常规检测分组

  

(1)过表达对照+启动子对照+海肾内参(TK)

(2)过表达对照+启动子野生型+海肾内参(TK)

(3)过表达对照+启动子突变型+海肾内参(TK)

(4)转录因子过表达+启动子对照+海肾内参(TK)

(5)转录因子过表达+启动子野生型+海肾内参(TK)

(6)转录因子过表达+启动子突变型+海肾内参(TK)

 

实验预期结果

  01

转录因子促进靶基因启动子区转录活性

 

02

转录因子抑制靶基因启动子区转录活性

 

翌圣可提供双荧光素酶报告基因检测服务,加快基础研究及药物筛选进度

                                             

服务类型

客户提供

服务内容

周期

双荧光素酶验证miRNA 与靶基因3’UTR 相互作用

1、miRNA基因及物种(具体的ID信息)

2、靶基因基因及物种

3. 结合位点信息 

1、miRNA与3’UTR结合位点预测

2、方案设计、引物设计合成

3、miRNA mimics合成、质粒构建

4、细胞转染及报告基因检测

 

25-30个工作日

双荧光素酶验证lncRNA 与miRNA 相互作用

1、lcnRNA基因及物种

2、miRNA基因及物种(具体的ID信息)

3、结合位点信息

1、lncRNA 与miRNA结合位点预测

2、方案设计、引物设计合成

3、miRNA mimics合成、质粒构建

4、细胞转染及报告基因检测

25-30个工作日

双荧光素酶验证转录因子与启动子区调控作用

1、启动子信息(名称、物种、序列)

2、启动子基因模板(或委托我司合成/克隆)

3、 实验用细胞(若选用293T细胞无需提供)

1、转录因子与启动子结合位点预测

2、方案设计、引物设计合成

3、序列合成、质粒构建

4、细胞转染及报告基因检测

30-35个工作日

信号通路分析

通路下游的响应元件序列

1、方案设计、引物设计合成

2、序列合成、质粒构建
3、细胞转染及报告基因检测

30-35个工作日

SNP 活性分析

基因的启动子区域存在单核苷酸多态性(SNP)信息

1、方案设计、引物设计合成

2、序列合成、质粒构建
3、细胞转染及报告基因检测

30-35个工作日

 

 

相关产品清单

                                             

 

产品类别

产品名称

产品货号

产品规格

双荧光素酶报告基因检测试剂

Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit 双萤光素酶报告基因检测试剂盒

11402ES60/80

100T/1000T

Dual Glo Luciferase Reporter Gene Assay Kit 辉光型双荧光素酶报告基因检测试剂盒

11405ES60/80

100T/1000T

转染试剂

Hieff Trans® Liposomal Transfection Reagent 转染试剂

40802ES01/03

100μL/1mL

Hieff Trans® in vitro siRNA/miRNA Transfection Reagent转染试剂

40806ES01/02/03

0.1mL/0.5mL /1mL

Hieff Trans® mRNA Transfection Reagent 转染试剂

40809ES01/03

0.1mL/1mL

 

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